Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
RRP7BPQ9NSQ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
RRP7BPQ9NSQ0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RRP7BPQ9NSQ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
RRP7BPQ9NSQ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RRP7BPQ9NSQ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
RRP7BPQ9NSQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RRP7BPQ9NSQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
RRP7BPQ9NSQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
RRP7BPQ9NSQ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
RRP7BPQ9NSQ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
RRP7BPQ9NSQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RRP7BPQ9NSQ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RRP7BPQ9NSQ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
RRP7BPQ9NSQ0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
RRP7BPQ9NSQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
RRP7BPQ9NSQ0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
RRP7BPQ9NSQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RRP7BPQ9NSQ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RRP7BPQ9NSQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RRP7BPQ9NSQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
RRP7BPQ9NSQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
RRP7BPQ9NSQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
RRP7BPQ9NSQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
RRP7BPQ9NSQ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
RRP7BPQ9NSQ0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RRP7BPQ9NSQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
RRP7BPQ9NSQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RRP7BPQ9NSQ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RRP7BPQ9NSQ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RRP7BPQ9NSQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RRP7BPQ9NSQ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
RRP7BPQ9NSQ0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RRP7BPQ9NSQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RRP7BPQ9NSQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RRP7BPQ9NSQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RRP7BPQ9NSQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RRP7BPQ9NSQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
RRP7BPQ9NSQ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
RRP7BPQ9NSQ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RRP7BPQ9NSQ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
RRP7BPQ9NSQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
RRP7BPQ9NSQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
RRP7BPQ9NSQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RRP7BPQ9NSQ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RRP7BPQ9NSQ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RRP7BPQ9NSQ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC40.05■■■■■ 4
RRP7BPQ9NSQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
RRP7BPQ9NSQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
RRP7BPQ9NSQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
RRP7BPQ9NSQ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
RRP7BPQ9NSQ0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
RRP7BPQ9NSQ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.95■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
RRP7BPQ9NSQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
RRP7BPQ9NSQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms