Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTG1Q9NSN8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNTG1Q9NSN8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG1Q9NSN8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG1Q9NSN8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNTG1Q9NSN8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNTG1Q9NSN8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNTG1Q9NSN8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTG1Q9NSN8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTG1Q9NSN8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTG1Q9NSN8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNTG1Q9NSN8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNTG1Q9NSN8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNTG1Q9NSN8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNTG1Q9NSN8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNTG1Q9NSN8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNTG1Q9NSN8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNTG1Q9NSN8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNTG1Q9NSN8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNTG1Q9NSN8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNTG1Q9NSN8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNTG1Q9NSN8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNTG1Q9NSN8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNTG1Q9NSN8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNTG1Q9NSN8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNTG1Q9NSN8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNTG1Q9NSN8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNTG1Q9NSN8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNTG1Q9NSN8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNTG1Q9NSN8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms