Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SALL1Q9NSC2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SALL1Q9NSC2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SALL1Q9NSC2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SALL1Q9NSC2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SALL1Q9NSC2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SALL1Q9NSC2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SALL1Q9NSC2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SALL1Q9NSC2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SALL1Q9NSC2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SALL1Q9NSC2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SALL1Q9NSC2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
SALL1Q9NSC2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SALL1Q9NSC2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SALL1Q9NSC2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SALL1Q9NSC2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SALL1Q9NSC2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SALL1Q9NSC2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
SALL1Q9NSC2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SALL1Q9NSC2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SALL1Q9NSC2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SALL1Q9NSC2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms