Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCNIP2Q9NS61 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNIP2Q9NS61 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNIP2Q9NS61 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KCNIP2Q9NS61 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KCNIP2Q9NS61 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms