Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRAC1Q9NRG0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRAC1Q9NRG0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHRAC1Q9NRG0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHRAC1Q9NRG0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRAC1Q9NRG0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms