Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FBXO6Q9NRD1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FBXO6Q9NRD1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FBXO6Q9NRD1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FBXO6Q9NRD1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FBXO6Q9NRD1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FBXO6Q9NRD1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO6Q9NRD1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FBXO6Q9NRD1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FBXO6Q9NRD1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.4 ms