Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CD163L1Q9NR16 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CD163L1Q9NR16 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CD163L1Q9NR16 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CD163L1Q9NR16 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CD163L1Q9NR16 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CD163L1Q9NR16 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CD163L1Q9NR16 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
CD163L1Q9NR16 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CD163L1Q9NR16 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CD163L1Q9NR16 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CD163L1Q9NR16 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
CD163L1Q9NR16 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CD163L1Q9NR16 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CD163L1Q9NR16 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CD163L1Q9NR16 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CD163L1Q9NR16 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CD163L1Q9NR16 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CD163L1Q9NR16 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
CD163L1Q9NR16 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CD163L1Q9NR16 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
CD163L1Q9NR16 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CD163L1Q9NR16 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CD163L1Q9NR16 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CD163L1Q9NR16 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CD163L1Q9NR16 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CD163L1Q9NR16 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CD163L1Q9NR16 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CD163L1Q9NR16 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CD163L1Q9NR16 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CD163L1Q9NR16 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CD163L1Q9NR16 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CD163L1Q9NR16 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
CD163L1Q9NR16 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CD163L1Q9NR16 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CD163L1Q9NR16 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CD163L1Q9NR16 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CD163L1Q9NR16 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CD163L1Q9NR16 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CD163L1Q9NR16 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CD163L1Q9NR16 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CD163L1Q9NR16 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CD163L1Q9NR16 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CD163L1Q9NR16 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CD163L1Q9NR16 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CD163L1Q9NR16 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CD163L1Q9NR16 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CD163L1Q9NR16 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
CD163L1Q9NR16 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
CD163L1Q9NR16 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CD163L1Q9NR16 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CD163L1Q9NR16 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CD163L1Q9NR16 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CD163L1Q9NR16 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CD163L1Q9NR16 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CD163L1Q9NR16 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CD163L1Q9NR16 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CD163L1Q9NR16 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CD163L1Q9NR16 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CD163L1Q9NR16 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CD163L1Q9NR16 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CD163L1Q9NR16 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CD163L1Q9NR16 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CD163L1Q9NR16 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CD163L1Q9NR16 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CD163L1Q9NR16 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CD163L1Q9NR16 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CD163L1Q9NR16 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CD163L1Q9NR16 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CD163L1Q9NR16 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CD163L1Q9NR16 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CD163L1Q9NR16 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CD163L1Q9NR16 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CD163L1Q9NR16 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CD163L1Q9NR16 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CD163L1Q9NR16 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CD163L1Q9NR16 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CD163L1Q9NR16 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CD163L1Q9NR16 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CD163L1Q9NR16 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CD163L1Q9NR16 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CD163L1Q9NR16 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CD163L1Q9NR16 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CD163L1Q9NR16 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CD163L1Q9NR16 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CD163L1Q9NR16 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CD163L1Q9NR16 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms