Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC8

IFT46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT46Q9NQC8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT46Q9NQC8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT46Q9NQC8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT46Q9NQC8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT46Q9NQC8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT46Q9NQC8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT46Q9NQC8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT46Q9NQC8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT46Q9NQC8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT46Q9NQC8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT46Q9NQC8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT46Q9NQC8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT46Q9NQC8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT46Q9NQC8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT46Q9NQC8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT46Q9NQC8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT46Q9NQC8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IFT46Q9NQC8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFT46Q9NQC8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFT46Q9NQC8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms