Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP3Q9NQ35 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NRIP3Q9NQ35 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NRIP3Q9NQ35 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP3Q9NQ35 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP3Q9NQ35 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRIP3Q9NQ35 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP3Q9NQ35 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP3Q9NQ35 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRIP3Q9NQ35 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NRIP3Q9NQ35 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NRIP3Q9NQ35 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NRIP3Q9NQ35 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP3Q9NQ35 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRIP3Q9NQ35 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP3Q9NQ35 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRIP3Q9NQ35 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP3Q9NQ35 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NRIP3Q9NQ35 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRIP3Q9NQ35 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NRIP3Q9NQ35 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NRIP3Q9NQ35 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NRIP3Q9NQ35 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NRIP3Q9NQ35 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NRIP3Q9NQ35 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NRIP3Q9NQ35 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms