Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC21

SLC25A19, Mitochondrial thiamine pyrophosphate carrier, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A19Q9HC21 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A19Q9HC21 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC25A19Q9HC21 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC25A19Q9HC21 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC25A19Q9HC21 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC25A19Q9HC21 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A19Q9HC21 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A19Q9HC21 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A19Q9HC21 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A19Q9HC21 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A19Q9HC21 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A19Q9HC21 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A19Q9HC21 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A19Q9HC21 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC25A19Q9HC21 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC25A19Q9HC21 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC25A19Q9HC21 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC25A19Q9HC21 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC25A19Q9HC21 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC25A19Q9HC21 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A19Q9HC21 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A19Q9HC21 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A19Q9HC21 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A19Q9HC21 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC25A19Q9HC21 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A19Q9HC21 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A19Q9HC21 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A19Q9HC21 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A19Q9HC21 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC25A19Q9HC21 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC25A19Q9HC21 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC25A19Q9HC21 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC25A19Q9HC21 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms