Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Z4

RANBP3, Ran-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP3Q9H6Z4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP3Q9H6Z4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP3Q9H6Z4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RANBP3Q9H6Z4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANBP3Q9H6Z4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANBP3Q9H6Z4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANBP3Q9H6Z4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RANBP3Q9H6Z4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANBP3Q9H6Z4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RANBP3Q9H6Z4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANBP3Q9H6Z4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RANBP3Q9H6Z4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANBP3Q9H6Z4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANBP3Q9H6Z4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RANBP3Q9H6Z4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RANBP3Q9H6Z4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RANBP3Q9H6Z4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RANBP3Q9H6Z4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms