Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPHX3Q9H6B9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPHX3Q9H6B9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPHX3Q9H6B9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPHX3Q9H6B9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPHX3Q9H6B9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPHX3Q9H6B9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPHX3Q9H6B9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPHX3Q9H6B9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHX3Q9H6B9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPHX3Q9H6B9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPHX3Q9H6B9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPHX3Q9H6B9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPHX3Q9H6B9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPHX3Q9H6B9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPHX3Q9H6B9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPHX3Q9H6B9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPHX3Q9H6B9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPHX3Q9H6B9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPHX3Q9H6B9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPHX3Q9H6B9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPHX3Q9H6B9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPHX3Q9H6B9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPHX3Q9H6B9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPHX3Q9H6B9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPHX3Q9H6B9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPHX3Q9H6B9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EPHX3Q9H6B9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EPHX3Q9H6B9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPHX3Q9H6B9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPHX3Q9H6B9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPHX3Q9H6B9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EPHX3Q9H6B9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPHX3Q9H6B9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPHX3Q9H6B9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHX3Q9H6B9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHX3Q9H6B9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHX3Q9H6B9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHX3Q9H6B9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EPHX3Q9H6B9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPHX3Q9H6B9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EPHX3Q9H6B9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EPHX3Q9H6B9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EPHX3Q9H6B9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms