Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLSTN2Q9H4D0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLSTN2Q9H4D0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLSTN2Q9H4D0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLSTN2Q9H4D0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLSTN2Q9H4D0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLSTN2Q9H4D0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLSTN2Q9H4D0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLSTN2Q9H4D0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLSTN2Q9H4D0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLSTN2Q9H4D0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLSTN2Q9H4D0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLSTN2Q9H4D0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLSTN2Q9H4D0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLSTN2Q9H4D0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLSTN2Q9H4D0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLSTN2Q9H4D0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLSTN2Q9H4D0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLSTN2Q9H4D0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLSTN2Q9H4D0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLSTN2Q9H4D0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSTN2Q9H4D0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSTN2Q9H4D0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSTN2Q9H4D0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLSTN2Q9H4D0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CLSTN2Q9H4D0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSTN2Q9H4D0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSTN2Q9H4D0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSTN2Q9H4D0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLSTN2Q9H4D0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLSTN2Q9H4D0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLSTN2Q9H4D0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLSTN2Q9H4D0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CLSTN2Q9H4D0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLSTN2Q9H4D0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLSTN2Q9H4D0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLSTN2Q9H4D0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CLSTN2Q9H4D0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CLSTN2Q9H4D0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CLSTN2Q9H4D0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLSTN2Q9H4D0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLSTN2Q9H4D0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLSTN2Q9H4D0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLSTN2Q9H4D0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLSTN2Q9H4D0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSTN2Q9H4D0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLSTN2Q9H4D0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSTN2Q9H4D0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSTN2Q9H4D0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSTN2Q9H4D0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSTN2Q9H4D0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLSTN2Q9H4D0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLSTN2Q9H4D0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms