Protein–RNA interactions for Protein: Q9H321

VCX3B, Variable charge X-linked protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3BQ9H321 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCX3BQ9H321 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCX3BQ9H321 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VCX3BQ9H321 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCX3BQ9H321 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCX3BQ9H321 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCX3BQ9H321 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCX3BQ9H321 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCX3BQ9H321 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VCX3BQ9H321 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCX3BQ9H321 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VCX3BQ9H321 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VCX3BQ9H321 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VCX3BQ9H321 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VCX3BQ9H321 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms