Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIXL1Q9H2W2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIXL1Q9H2W2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MIXL1Q9H2W2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIXL1Q9H2W2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MIXL1Q9H2W2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MIXL1Q9H2W2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIXL1Q9H2W2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIXL1Q9H2W2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIXL1Q9H2W2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MIXL1Q9H2W2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MIXL1Q9H2W2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MIXL1Q9H2W2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIXL1Q9H2W2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MIXL1Q9H2W2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MIXL1Q9H2W2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MIXL1Q9H2W2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIXL1Q9H2W2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MIXL1Q9H2W2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIXL1Q9H2W2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIXL1Q9H2W2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIXL1Q9H2W2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIXL1Q9H2W2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIXL1Q9H2W2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MIXL1Q9H2W2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIXL1Q9H2W2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MIXL1Q9H2W2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MIXL1Q9H2W2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIXL1Q9H2W2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIXL1Q9H2W2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIXL1Q9H2W2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MIXL1Q9H2W2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MIXL1Q9H2W2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms