Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNMDQ9H2S6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TNMDQ9H2S6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TNMDQ9H2S6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TNMDQ9H2S6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNMDQ9H2S6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TNMDQ9H2S6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TNMDQ9H2S6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TNMDQ9H2S6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNMDQ9H2S6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNMDQ9H2S6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNMDQ9H2S6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TNMDQ9H2S6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TNMDQ9H2S6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TNMDQ9H2S6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNMDQ9H2S6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TNMDQ9H2S6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNMDQ9H2S6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TNMDQ9H2S6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TNMDQ9H2S6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TNMDQ9H2S6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNMDQ9H2S6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNMDQ9H2S6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TNMDQ9H2S6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TNMDQ9H2S6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TNMDQ9H2S6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNMDQ9H2S6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TNMDQ9H2S6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TNMDQ9H2S6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TNMDQ9H2S6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TNMDQ9H2S6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNMDQ9H2S6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TNMDQ9H2S6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNMDQ9H2S6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TNMDQ9H2S6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TNMDQ9H2S6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNMDQ9H2S6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNMDQ9H2S6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TNMDQ9H2S6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNMDQ9H2S6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TNMDQ9H2S6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNMDQ9H2S6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TNMDQ9H2S6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNMDQ9H2S6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TNMDQ9H2S6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TNMDQ9H2S6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms