Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MTIF3Q9H2K0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MTIF3Q9H2K0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MTIF3Q9H2K0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MTIF3Q9H2K0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTIF3Q9H2K0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MTIF3Q9H2K0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTIF3Q9H2K0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTIF3Q9H2K0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTIF3Q9H2K0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MTIF3Q9H2K0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MTIF3Q9H2K0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MTIF3Q9H2K0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MTIF3Q9H2K0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MTIF3Q9H2K0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTIF3Q9H2K0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MTIF3Q9H2K0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MTIF3Q9H2K0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MTIF3Q9H2K0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MTIF3Q9H2K0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MTIF3Q9H2K0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MTIF3Q9H2K0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MTIF3Q9H2K0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MTIF3Q9H2K0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTIF3Q9H2K0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MTIF3Q9H2K0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MTIF3Q9H2K0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MTIF3Q9H2K0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MTIF3Q9H2K0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MTIF3Q9H2K0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MTIF3Q9H2K0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTIF3Q9H2K0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTIF3Q9H2K0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MTIF3Q9H2K0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms