Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1K1

ISCU, Iron-sulfur cluster assembly enzyme ISCU, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISCUQ9H1K1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ISCUQ9H1K1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ISCUQ9H1K1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ISCUQ9H1K1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ISCUQ9H1K1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ISCUQ9H1K1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ISCUQ9H1K1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ISCUQ9H1K1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ISCUQ9H1K1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ISCUQ9H1K1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ISCUQ9H1K1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ISCUQ9H1K1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ISCUQ9H1K1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ISCUQ9H1K1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ISCUQ9H1K1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ISCUQ9H1K1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ISCUQ9H1K1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ISCUQ9H1K1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ISCUQ9H1K1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ISCUQ9H1K1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ISCUQ9H1K1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ISCUQ9H1K1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ISCUQ9H1K1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ISCUQ9H1K1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ISCUQ9H1K1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ISCUQ9H1K1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ISCUQ9H1K1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ISCUQ9H1K1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ISCUQ9H1K1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ISCUQ9H1K1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ISCUQ9H1K1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ISCUQ9H1K1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ISCUQ9H1K1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ISCUQ9H1K1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ISCUQ9H1K1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ISCUQ9H1K1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ISCUQ9H1K1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ISCUQ9H1K1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ISCUQ9H1K1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ISCUQ9H1K1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ISCUQ9H1K1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ISCUQ9H1K1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ISCUQ9H1K1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ISCUQ9H1K1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ISCUQ9H1K1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ISCUQ9H1K1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ISCUQ9H1K1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ISCUQ9H1K1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ISCUQ9H1K1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ISCUQ9H1K1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ISCUQ9H1K1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ISCUQ9H1K1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ISCUQ9H1K1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ISCUQ9H1K1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms