Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZV3

SLC5A7, High affinity choline transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A7Q9GZV3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC5A7Q9GZV3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A7Q9GZV3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A7Q9GZV3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC5A7Q9GZV3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC5A7Q9GZV3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms