Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SPEF2Q9C093 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SPEF2Q9C093 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
SPEF2Q9C093 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SPEF2Q9C093 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPEF2Q9C093 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SPEF2Q9C093 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SPEF2Q9C093 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SPEF2Q9C093 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SPEF2Q9C093 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SPEF2Q9C093 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SPEF2Q9C093 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SPEF2Q9C093 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SPEF2Q9C093 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SPEF2Q9C093 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SPEF2Q9C093 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SPEF2Q9C093 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SPEF2Q9C093 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SPEF2Q9C093 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SPEF2Q9C093 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SPEF2Q9C093 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SPEF2Q9C093 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SPEF2Q9C093 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SPEF2Q9C093 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SPEF2Q9C093 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SPEF2Q9C093 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SPEF2Q9C093 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SPEF2Q9C093 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SPEF2Q9C093 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SPEF2Q9C093 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SPEF2Q9C093 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SPEF2Q9C093 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SPEF2Q9C093 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SPEF2Q9C093 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SPEF2Q9C093 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SPEF2Q9C093 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SPEF2Q9C093 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SPEF2Q9C093 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SPEF2Q9C093 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SPEF2Q9C093 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SPEF2Q9C093 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
SPEF2Q9C093 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SPEF2Q9C093 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SPEF2Q9C093 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SPEF2Q9C093 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SPEF2Q9C093 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms