Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM6Q9C030 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM6Q9C030 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM6Q9C030 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM6Q9C030 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRIM6Q9C030 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRIM6Q9C030 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM6Q9C030 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM6Q9C030 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM6Q9C030 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM6Q9C030 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM6Q9C030 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM6Q9C030 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM6Q9C030 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM6Q9C030 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM6Q9C030 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRIM6Q9C030 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM6Q9C030 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRIM6Q9C030 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRIM6Q9C030 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM6Q9C030 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRIM6Q9C030 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms