Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKD2Q9BZL6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKD2Q9BZL6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKD2Q9BZL6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKD2Q9BZL6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKD2Q9BZL6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKD2Q9BZL6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKD2Q9BZL6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKD2Q9BZL6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKD2Q9BZL6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRKD2Q9BZL6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRKD2Q9BZL6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRKD2Q9BZL6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKD2Q9BZL6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRKD2Q9BZL6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRKD2Q9BZL6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRKD2Q9BZL6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKD2Q9BZL6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKD2Q9BZL6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRKD2Q9BZL6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKD2Q9BZL6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKD2Q9BZL6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRKD2Q9BZL6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms