Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PITPNM3Q9BZ71 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PITPNM3Q9BZ71 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PITPNM3Q9BZ71 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PITPNM3Q9BZ71 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PITPNM3Q9BZ71 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PITPNM3Q9BZ71 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PITPNM3Q9BZ71 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PITPNM3Q9BZ71 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PITPNM3Q9BZ71 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PITPNM3Q9BZ71 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PITPNM3Q9BZ71 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PITPNM3Q9BZ71 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PITPNM3Q9BZ71 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PITPNM3Q9BZ71 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PITPNM3Q9BZ71 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PITPNM3Q9BZ71 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PITPNM3Q9BZ71 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PITPNM3Q9BZ71 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PITPNM3Q9BZ71 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PITPNM3Q9BZ71 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PITPNM3Q9BZ71 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms