Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV94

EDEM2, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM2Q9BV94 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDEM2Q9BV94 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EDEM2Q9BV94 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDEM2Q9BV94 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDEM2Q9BV94 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDEM2Q9BV94 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDEM2Q9BV94 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDEM2Q9BV94 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDEM2Q9BV94 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDEM2Q9BV94 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDEM2Q9BV94 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDEM2Q9BV94 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDEM2Q9BV94 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDEM2Q9BV94 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDEM2Q9BV94 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDEM2Q9BV94 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDEM2Q9BV94 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDEM2Q9BV94 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDEM2Q9BV94 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDEM2Q9BV94 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDEM2Q9BV94 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDEM2Q9BV94 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDEM2Q9BV94 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDEM2Q9BV94 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDEM2Q9BV94 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDEM2Q9BV94 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDEM2Q9BV94 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM2Q9BV94 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDEM2Q9BV94 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDEM2Q9BV94 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM2Q9BV94 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM2Q9BV94 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM2Q9BV94 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM2Q9BV94 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EDEM2Q9BV94 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EDEM2Q9BV94 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM2Q9BV94 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM2Q9BV94 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM2Q9BV94 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM2Q9BV94 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM2Q9BV94 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM2Q9BV94 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EDEM2Q9BV94 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms