Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV73

CEP250, Centrosome-associated protein CEP250, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP250Q9BV73 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP250Q9BV73 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CEP250Q9BV73 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP250Q9BV73 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CEP250Q9BV73 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CEP250Q9BV73 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CEP250Q9BV73 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP250Q9BV73 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP250Q9BV73 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP250Q9BV73 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CEP250Q9BV73 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP250Q9BV73 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CEP250Q9BV73 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP250Q9BV73 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CEP250Q9BV73 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
CEP250Q9BV73 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CEP250Q9BV73 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CEP250Q9BV73 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP250Q9BV73 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP250Q9BV73 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP250Q9BV73 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP250Q9BV73 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CEP250Q9BV73 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP250Q9BV73 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CEP250Q9BV73 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP250Q9BV73 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP250Q9BV73 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP250Q9BV73 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CEP250Q9BV73 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CEP250Q9BV73 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CEP250Q9BV73 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CEP250Q9BV73 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CEP250Q9BV73 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP250Q9BV73 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CEP250Q9BV73 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP250Q9BV73 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CEP250Q9BV73 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP250Q9BV73 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CEP250Q9BV73 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP250Q9BV73 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP250Q9BV73 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP250Q9BV73 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP250Q9BV73 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CEP250Q9BV73 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CEP250Q9BV73 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms