Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC32Q9BV29 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC32Q9BV29 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC32Q9BV29 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC32Q9BV29 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC32Q9BV29 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC32Q9BV29 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC32Q9BV29 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC32Q9BV29 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC32Q9BV29 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC32Q9BV29 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC32Q9BV29 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC32Q9BV29 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC32Q9BV29 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC32Q9BV29 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC32Q9BV29 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC32Q9BV29 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC32Q9BV29 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC32Q9BV29 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC32Q9BV29 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC32Q9BV29 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC32Q9BV29 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC32Q9BV29 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC32Q9BV29 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC32Q9BV29 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC32Q9BV29 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC32Q9BV29 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC32Q9BV29 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC32Q9BV29 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC32Q9BV29 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC32Q9BV29 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC32Q9BV29 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC32Q9BV29 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC32Q9BV29 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC32Q9BV29 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC32Q9BV29 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms