Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB6Q9BUF5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TUBB6Q9BUF5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB6Q9BUF5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB6Q9BUF5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBB6Q9BUF5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TUBB6Q9BUF5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBB6Q9BUF5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB6Q9BUF5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB6Q9BUF5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TUBB6Q9BUF5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB6Q9BUF5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBB6Q9BUF5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBB6Q9BUF5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB6Q9BUF5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB6Q9BUF5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB6Q9BUF5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB6Q9BUF5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBB6Q9BUF5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TUBB6Q9BUF5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TUBB6Q9BUF5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB6Q9BUF5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB6Q9BUF5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TUBB6Q9BUF5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB6Q9BUF5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB6Q9BUF5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBB6Q9BUF5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBB6Q9BUF5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TUBB6Q9BUF5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TUBB6Q9BUF5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBB6Q9BUF5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBB6Q9BUF5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBB6Q9BUF5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 316.4 ms