Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRFN3Q9BTN0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRFN3Q9BTN0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRFN3Q9BTN0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRFN3Q9BTN0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRFN3Q9BTN0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRFN3Q9BTN0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRFN3Q9BTN0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRFN3Q9BTN0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRFN3Q9BTN0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRFN3Q9BTN0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRFN3Q9BTN0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRFN3Q9BTN0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRFN3Q9BTN0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRFN3Q9BTN0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRFN3Q9BTN0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRFN3Q9BTN0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRFN3Q9BTN0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRFN3Q9BTN0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRFN3Q9BTN0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRFN3Q9BTN0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRFN3Q9BTN0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LRFN3Q9BTN0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRFN3Q9BTN0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRFN3Q9BTN0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRFN3Q9BTN0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRFN3Q9BTN0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRFN3Q9BTN0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRFN3Q9BTN0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRFN3Q9BTN0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRFN3Q9BTN0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRFN3Q9BTN0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRFN3Q9BTN0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRFN3Q9BTN0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRFN3Q9BTN0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRFN3Q9BTN0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
LRFN3Q9BTN0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRFN3Q9BTN0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms