Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
MTA3Q9BTC8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MTA3Q9BTC8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MTA3Q9BTC8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MTA3Q9BTC8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MTA3Q9BTC8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MTA3Q9BTC8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
MTA3Q9BTC8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MTA3Q9BTC8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
MTA3Q9BTC8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MTA3Q9BTC8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MTA3Q9BTC8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MTA3Q9BTC8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MTA3Q9BTC8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MTA3Q9BTC8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MTA3Q9BTC8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MTA3Q9BTC8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MTA3Q9BTC8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MTA3Q9BTC8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MTA3Q9BTC8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MTA3Q9BTC8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MTA3Q9BTC8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MTA3Q9BTC8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MTA3Q9BTC8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MTA3Q9BTC8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MTA3Q9BTC8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MTA3Q9BTC8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
MTA3Q9BTC8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
MTA3Q9BTC8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MTA3Q9BTC8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MTA3Q9BTC8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
MTA3Q9BTC8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
MTA3Q9BTC8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
MTA3Q9BTC8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
MTA3Q9BTC8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms