Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYT11Q9BT88 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYT11Q9BT88 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYT11Q9BT88 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYT11Q9BT88 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYT11Q9BT88 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYT11Q9BT88 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT11Q9BT88 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYT11Q9BT88 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYT11Q9BT88 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYT11Q9BT88 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYT11Q9BT88 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT11Q9BT88 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SYT11Q9BT88 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYT11Q9BT88 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SYT11Q9BT88 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SYT11Q9BT88 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYT11Q9BT88 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYT11Q9BT88 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYT11Q9BT88 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT11Q9BT88 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYT11Q9BT88 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT11Q9BT88 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYT11Q9BT88 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYT11Q9BT88 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT11Q9BT88 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYT11Q9BT88 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT11Q9BT88 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYT11Q9BT88 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYT11Q9BT88 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYT11Q9BT88 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SYT11Q9BT88 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYT11Q9BT88 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYT11Q9BT88 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYT11Q9BT88 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYT11Q9BT88 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT11Q9BT88 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT11Q9BT88 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYT11Q9BT88 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms