Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NIPSNAP3BQ9BS92 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIPSNAP3BQ9BS92 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3BQ9BS92 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms