Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RHOXF2Q9BQY4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RHOXF2Q9BQY4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOXF2Q9BQY4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOXF2Q9BQY4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHOXF2Q9BQY4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHOXF2Q9BQY4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHOXF2Q9BQY4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHOXF2Q9BQY4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHOXF2Q9BQY4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOXF2Q9BQY4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHOXF2Q9BQY4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHOXF2Q9BQY4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHOXF2Q9BQY4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RHOXF2Q9BQY4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RHOXF2Q9BQY4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RHOXF2Q9BQY4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RHOXF2Q9BQY4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RHOXF2Q9BQY4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RHOXF2Q9BQY4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RHOXF2Q9BQY4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHOXF2Q9BQY4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RHOXF2Q9BQY4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHOXF2Q9BQY4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHOXF2Q9BQY4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHOXF2Q9BQY4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHOXF2Q9BQY4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RHOXF2Q9BQY4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms