Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GORASP1Q9BQQ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GORASP1Q9BQQ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GORASP1Q9BQQ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GORASP1Q9BQQ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GORASP1Q9BQQ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GORASP1Q9BQQ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GORASP1Q9BQQ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GORASP1Q9BQQ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GORASP1Q9BQQ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GORASP1Q9BQQ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GORASP1Q9BQQ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GORASP1Q9BQQ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GORASP1Q9BQQ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GORASP1Q9BQQ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms