Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRRX2Q99811 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRRX2Q99811 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRRX2Q99811 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRRX2Q99811 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRRX2Q99811 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRRX2Q99811 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRRX2Q99811 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRRX2Q99811 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRRX2Q99811 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRRX2Q99811 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRRX2Q99811 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRRX2Q99811 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRRX2Q99811 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRRX2Q99811 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRRX2Q99811 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRRX2Q99811 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRRX2Q99811 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRRX2Q99811 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRRX2Q99811 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRRX2Q99811 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRRX2Q99811 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRRX2Q99811 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRRX2Q99811 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRRX2Q99811 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRRX2Q99811 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRRX2Q99811 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRRX2Q99811 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRRX2Q99811 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRRX2Q99811 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRRX2Q99811 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRRX2Q99811 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRRX2Q99811 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRRX2Q99811 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRRX2Q99811 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRRX2Q99811 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRRX2Q99811 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRRX2Q99811 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRRX2Q99811 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRRX2Q99811 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRRX2Q99811 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRRX2Q99811 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRRX2Q99811 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRRX2Q99811 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRRX2Q99811 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRRX2Q99811 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRRX2Q99811 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRRX2Q99811 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRRX2Q99811 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRRX2Q99811 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRRX2Q99811 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRRX2Q99811 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRRX2Q99811 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRRX2Q99811 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms