Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GFI1Q99684 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFI1Q99684 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFI1Q99684 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFI1Q99684 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFI1Q99684 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GFI1Q99684 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GFI1Q99684 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GFI1Q99684 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFI1Q99684 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFI1Q99684 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFI1Q99684 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFI1Q99684 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFI1Q99684 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GFI1Q99684 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFI1Q99684 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFI1Q99684 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFI1Q99684 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GFI1Q99684 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GFI1Q99684 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GFI1Q99684 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFI1Q99684 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFI1Q99684 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFI1Q99684 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GFI1Q99684 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GFI1Q99684 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GFI1Q99684 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFI1Q99684 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFI1Q99684 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFI1Q99684 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFI1Q99684 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GFI1Q99684 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFI1Q99684 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GFI1Q99684 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GFI1Q99684 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms