Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NDNQ99608 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NDNQ99608 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NDNQ99608 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NDNQ99608 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NDNQ99608 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NDNQ99608 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NDNQ99608 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NDNQ99608 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NDNQ99608 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NDNQ99608 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NDNQ99608 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDNQ99608 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDNQ99608 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDNQ99608 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDNQ99608 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDNQ99608 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDNQ99608 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDNQ99608 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NDNQ99608 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NDNQ99608 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NDNQ99608 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NDNQ99608 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NDNQ99608 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NDNQ99608 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NDNQ99608 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDNQ99608 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDNQ99608 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NDNQ99608 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NDNQ99608 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NDNQ99608 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NDNQ99608 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NDNQ99608 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NDNQ99608 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDNQ99608 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDNQ99608 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NDNQ99608 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDNQ99608 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDNQ99608 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NDNQ99608 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDNQ99608 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDNQ99608 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NDNQ99608 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDNQ99608 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDNQ99608 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NDNQ99608 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDNQ99608 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NDNQ99608 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDNQ99608 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDNQ99608 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDNQ99608 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NDNQ99608 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDNQ99608 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDNQ99608 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NDNQ99608 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDNQ99608 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NDNQ99608 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NDNQ99608 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDNQ99608 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDNQ99608 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDNQ99608 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NDNQ99608 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDNQ99608 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDNQ99608 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDNQ99608 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NDNQ99608 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDNQ99608 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NDNQ99608 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NDNQ99608 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDNQ99608 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDNQ99608 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDNQ99608 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NDNQ99608 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDNQ99608 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NDNQ99608 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDNQ99608 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NDNQ99608 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NDNQ99608 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDNQ99608 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NDNQ99608 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDNQ99608 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NDNQ99608 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NDNQ99608 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDNQ99608 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NDNQ99608 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDNQ99608 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NDNQ99608 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDNQ99608 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDNQ99608 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDNQ99608 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDNQ99608 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDNQ99608 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDNQ99608 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NDNQ99608 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDNQ99608 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDNQ99608 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NDNQ99608 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDNQ99608 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDNQ99608 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NDNQ99608 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms