Protein–RNA interactions for Protein: Q96T58

SPEN, Msx2-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPENQ96T58 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPENQ96T58 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPENQ96T58 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPENQ96T58 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPENQ96T58 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPENQ96T58 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPENQ96T58 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPENQ96T58 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPENQ96T58 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPENQ96T58 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPENQ96T58 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPENQ96T58 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPENQ96T58 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPENQ96T58 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPENQ96T58 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPENQ96T58 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPENQ96T58 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPENQ96T58 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPENQ96T58 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms