Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF607Q96SK3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF607Q96SK3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF607Q96SK3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF607Q96SK3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF607Q96SK3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF607Q96SK3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF607Q96SK3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF607Q96SK3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF607Q96SK3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF607Q96SK3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF607Q96SK3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF607Q96SK3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF607Q96SK3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF607Q96SK3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF607Q96SK3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF607Q96SK3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF607Q96SK3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF607Q96SK3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF607Q96SK3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF607Q96SK3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF607Q96SK3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF607Q96SK3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF607Q96SK3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF607Q96SK3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF607Q96SK3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF607Q96SK3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF607Q96SK3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF607Q96SK3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF607Q96SK3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF607Q96SK3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF607Q96SK3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF607Q96SK3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF607Q96SK3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF607Q96SK3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF607Q96SK3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF607Q96SK3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF607Q96SK3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF607Q96SK3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF607Q96SK3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms