Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JMJD8Q96S16 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JMJD8Q96S16 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JMJD8Q96S16 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
JMJD8Q96S16 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
JMJD8Q96S16 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JMJD8Q96S16 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JMJD8Q96S16 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
JMJD8Q96S16 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
JMJD8Q96S16 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JMJD8Q96S16 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JMJD8Q96S16 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
JMJD8Q96S16 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
JMJD8Q96S16 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
JMJD8Q96S16 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JMJD8Q96S16 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms