Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC85AQ96PX6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCDC85AQ96PX6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC85AQ96PX6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CCDC85AQ96PX6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC85AQ96PX6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CCDC85AQ96PX6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC85AQ96PX6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC85AQ96PX6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC85AQ96PX6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CCDC85AQ96PX6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC85AQ96PX6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CCDC85AQ96PX6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC85AQ96PX6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CCDC85AQ96PX6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC85AQ96PX6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC85AQ96PX6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC85AQ96PX6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC85AQ96PX6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC85AQ96PX6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC85AQ96PX6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC85AQ96PX6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC85AQ96PX6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC85AQ96PX6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC85AQ96PX6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC85AQ96PX6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC85AQ96PX6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC85AQ96PX6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC85AQ96PX6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC85AQ96PX6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC85AQ96PX6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC85AQ96PX6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC85AQ96PX6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC85AQ96PX6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC85AQ96PX6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC85AQ96PX6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC85AQ96PX6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC85AQ96PX6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC85AQ96PX6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC85AQ96PX6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC85AQ96PX6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC85AQ96PX6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC85AQ96PX6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC85AQ96PX6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC85AQ96PX6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC85AQ96PX6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC85AQ96PX6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC85AQ96PX6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC85AQ96PX6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CCDC85AQ96PX6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CCDC85AQ96PX6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC85AQ96PX6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC85AQ96PX6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC85AQ96PX6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CCDC85AQ96PX6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CCDC85AQ96PX6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CCDC85AQ96PX6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC85AQ96PX6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CCDC85AQ96PX6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CCDC85AQ96PX6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms