Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PGLYRP2Q96PD5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PGLYRP2Q96PD5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PGLYRP2Q96PD5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PGLYRP2Q96PD5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PGLYRP2Q96PD5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGLYRP2Q96PD5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PGLYRP2Q96PD5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PGLYRP2Q96PD5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PGLYRP2Q96PD5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PGLYRP2Q96PD5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PGLYRP2Q96PD5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PGLYRP2Q96PD5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PGLYRP2Q96PD5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PGLYRP2Q96PD5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PGLYRP2Q96PD5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms