Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RILPQ96NA2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RILPQ96NA2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RILPQ96NA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RILPQ96NA2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RILPQ96NA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RILPQ96NA2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RILPQ96NA2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RILPQ96NA2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RILPQ96NA2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RILPQ96NA2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RILPQ96NA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RILPQ96NA2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RILPQ96NA2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RILPQ96NA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RILPQ96NA2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RILPQ96NA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RILPQ96NA2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RILPQ96NA2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RILPQ96NA2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RILPQ96NA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms