Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CCDC17Q96LX7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC17Q96LX7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC17Q96LX7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC17Q96LX7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC17Q96LX7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC17Q96LX7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC17Q96LX7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC17Q96LX7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC17Q96LX7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC17Q96LX7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC17Q96LX7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC17Q96LX7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC17Q96LX7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC17Q96LX7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC17Q96LX7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC17Q96LX7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC17Q96LX7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC17Q96LX7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC17Q96LX7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC17Q96LX7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC17Q96LX7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC17Q96LX7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC17Q96LX7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC17Q96LX7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CCDC17Q96LX7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CCDC17Q96LX7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CCDC17Q96LX7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC17Q96LX7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC17Q96LX7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC17Q96LX7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC17Q96LX7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CCDC17Q96LX7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC17Q96LX7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CCDC17Q96LX7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC17Q96LX7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC17Q96LX7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC17Q96LX7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CCDC17Q96LX7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC17Q96LX7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms