Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
KCNH8Q96L42 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
KCNH8Q96L42 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
KCNH8Q96L42 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
KCNH8Q96L42 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC42.36■■■■■ 4.37
KCNH8Q96L42 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
KCNH8Q96L42 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
KCNH8Q96L42 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
KCNH8Q96L42 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
KCNH8Q96L42 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
KCNH8Q96L42 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
KCNH8Q96L42 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
KCNH8Q96L42 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
KCNH8Q96L42 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.31■■■■■ 4.36
KCNH8Q96L42 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC42.3■■■■■ 4.36
KCNH8Q96L42 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
KCNH8Q96L42 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
KCNH8Q96L42 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
KCNH8Q96L42 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
KCNH8Q96L42 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
KCNH8Q96L42 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
KCNH8Q96L42 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
KCNH8Q96L42 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
KCNH8Q96L42 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
KCNH8Q96L42 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
KCNH8Q96L42 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
KCNH8Q96L42 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
KCNH8Q96L42 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
KCNH8Q96L42 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
KCNH8Q96L42 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
KCNH8Q96L42 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
KCNH8Q96L42 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
KCNH8Q96L42 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
KCNH8Q96L42 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
KCNH8Q96L42 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
KCNH8Q96L42 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
KCNH8Q96L42 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
KCNH8Q96L42 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
KCNH8Q96L42 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
KCNH8Q96L42 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
KCNH8Q96L42 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
KCNH8Q96L42 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
KCNH8Q96L42 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
KCNH8Q96L42 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
KCNH8Q96L42 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
KCNH8Q96L42 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
KCNH8Q96L42 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
KCNH8Q96L42 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
KCNH8Q96L42 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
KCNH8Q96L42 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
KCNH8Q96L42 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
KCNH8Q96L42 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
KCNH8Q96L42 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
KCNH8Q96L42 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
KCNH8Q96L42 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
KCNH8Q96L42 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
KCNH8Q96L42 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
KCNH8Q96L42 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
KCNH8Q96L42 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
KCNH8Q96L42 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC41.98■■■■■ 4.31
KCNH8Q96L42 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC41.96■■■■■ 4.31
KCNH8Q96L42 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
KCNH8Q96L42 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
KCNH8Q96L42 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
KCNH8Q96L42 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
KCNH8Q96L42 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
KCNH8Q96L42 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
KCNH8Q96L42 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
KCNH8Q96L42 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
KCNH8Q96L42 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
KCNH8Q96L42 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
KCNH8Q96L42 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
KCNH8Q96L42 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
KCNH8Q96L42 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
KCNH8Q96L42 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
KCNH8Q96L42 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
KCNH8Q96L42 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
KCNH8Q96L42 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
KCNH8Q96L42 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
KCNH8Q96L42 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
KCNH8Q96L42 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
KCNH8Q96L42 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
KCNH8Q96L42 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC41.71■■■■■ 4.27
KCNH8Q96L42 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
KCNH8Q96L42 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms