Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TIMD4Q96H15 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIMD4Q96H15 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIMD4Q96H15 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMD4Q96H15 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMD4Q96H15 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMD4Q96H15 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms