Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDXPQ96GD0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDXPQ96GD0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDXPQ96GD0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDXPQ96GD0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDXPQ96GD0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDXPQ96GD0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDXPQ96GD0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDXPQ96GD0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDXPQ96GD0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDXPQ96GD0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDXPQ96GD0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDXPQ96GD0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDXPQ96GD0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PDXPQ96GD0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDXPQ96GD0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDXPQ96GD0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDXPQ96GD0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDXPQ96GD0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDXPQ96GD0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDXPQ96GD0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDXPQ96GD0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms