Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX7

TRMT61A, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase catalytic subunit TRMT61A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61AQ96FX7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRMT61AQ96FX7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRMT61AQ96FX7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRMT61AQ96FX7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRMT61AQ96FX7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRMT61AQ96FX7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT61AQ96FX7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT61AQ96FX7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT61AQ96FX7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRMT61AQ96FX7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT61AQ96FX7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT61AQ96FX7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT61AQ96FX7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT61AQ96FX7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRMT61AQ96FX7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRMT61AQ96FX7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMT61AQ96FX7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMT61AQ96FX7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms