Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3CQ96E17 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3CQ96E17 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3CQ96E17 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3CQ96E17 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3CQ96E17 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3CQ96E17 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3CQ96E17 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3CQ96E17 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3CQ96E17 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3CQ96E17 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3CQ96E17 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3CQ96E17 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB3CQ96E17 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3CQ96E17 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB3CQ96E17 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3CQ96E17 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3CQ96E17 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms