Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTP4Q96DX8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTP4Q96DX8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTP4Q96DX8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTP4Q96DX8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RTP4Q96DX8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTP4Q96DX8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTP4Q96DX8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTP4Q96DX8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTP4Q96DX8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTP4Q96DX8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RTP4Q96DX8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP4Q96DX8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTP4Q96DX8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTP4Q96DX8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RTP4Q96DX8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTP4Q96DX8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTP4Q96DX8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RTP4Q96DX8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RTP4Q96DX8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP4Q96DX8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms