Protein–RNA interactions for Protein: Q96CU9

FOXRED1, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXRED1Q96CU9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXRED1Q96CU9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXRED1Q96CU9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXRED1Q96CU9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXRED1Q96CU9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXRED1Q96CU9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXRED1Q96CU9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXRED1Q96CU9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXRED1Q96CU9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXRED1Q96CU9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXRED1Q96CU9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXRED1Q96CU9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXRED1Q96CU9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXRED1Q96CU9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXRED1Q96CU9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXRED1Q96CU9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXRED1Q96CU9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXRED1Q96CU9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXRED1Q96CU9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXRED1Q96CU9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXRED1Q96CU9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXRED1Q96CU9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXRED1Q96CU9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXRED1Q96CU9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXRED1Q96CU9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXRED1Q96CU9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXRED1Q96CU9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXRED1Q96CU9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXRED1Q96CU9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXRED1Q96CU9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXRED1Q96CU9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXRED1Q96CU9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXRED1Q96CU9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXRED1Q96CU9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXRED1Q96CU9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms